L'IRM mammaire peut s'accompagner de multiples artefacts et pièges. Les artefacts sont inhérents à la technique de l'IRM alors que les pièges sont le plus souvent secondaires à des erreurs humaines. Les artefacts les plus fréquemment rencontrés sont les artefacts de mouvement, de projections cardiaques, du déplacement chimique et de susceptibilité magnétique. Les pièges les plus fréquents sont les défauts d'injection du produit de contraste ou de positionnement des patientes, les erreurs de positionnement de la zone d'intérêt ainsi que les erreurs d'identifications des rehaussements physiologiques et iatrogènes. Reconnaître ces artefacts et ces pièges en IRM mammaire permet de mieux les gérer et parfois de les supprimer. Pour cela, il faut utiliser des séquences optimisées. Il faut également expliquer aux patientes le déroulement de l'examen, veiller au bon positionnement des seins dans l'antenne et s'assurer que l'injection du produit de contraste est correcte. La zone d'intérêt doit se situer toujours sur la région la plus suspecte de la lésion analysée. Enfin, il est recommandé de réaliser l'IRM mammaire la deuxième semaine du cycle menstruel et d'arrêter le traitement hormonal substitutif deux mois auparavant quand c'est possible.