La citrulline plasmatique a émergé comme candidat biomarqueur innovant à la détermination de la fonctionnalité intestinale. Acide aminé pratiquement uniquement synthétisé par les entérocytes de la muqueuse intestinale, non contenu dans les protéines et les solutés de nutrition, la citrulline sert de précurseur à la production d'arginine par le rein. La citrulline plasmatique est en clinique un biomarqueur validé de la masse métabolique fonctionnelle entérocytaire active ou de trophicité de l'intestin grêle, tant chez l'enfant que chez l'adulte, dans les maladies intestinales sévères (grêle court, entéropathies diffuses, toxicité intestinale de la radio-chimiothérapie...). Sa concentration (30-50 μmol/L) est indépendante de l'état nutritionnel. Quand elle est inférieure à 10 μmol/L, elle donne une objectivité à la prescription de la nutrition parentérale en cas d'insuffisance intestinale par maladie ou absence des entérocytes. Sa détermination régulière permet le suivi de la fonction intestinale, à la réserve de la présence d'une insuffisance rénale significative.