Le méthotrexate est prescrit à faible dose, 7,5 mg à 15 mg et jusqu'à 25 mg si nécessaire, une fois par semaine, dans des pathologies inflammatoires, en particulier dans la polyarthrite rhumatoïde et le psoriasis. La réponse thérapeutique et la fréquence des effets indésirables sont très variables d'un patient à l'autre, reflets d'une forte variabilité interindividuelle des paramètres pharmacocinétiques du méthotrexate, en particulier de sa biodisponibilité, suggérant une base génétique. De nombreux polymorphismes étant impliqués (les transporteurs d'influx et d'efllux, les enzymes du métabolisme et du mécanisme d'action du méthotrexate), leur détermination en vue d'une prescription individualisée n'apparaît pas réaliste à l'heure actuelle. En revanche, une relation exposition effet, non pas tant en considérant les concentrations plasmatiques du méthotrexate mais celles de ses métabolites polyglutamylés intraérythrocytaires, a été décrite. Leur détermination devrait pouvoir contribuer à une adaptation des posologies plus rapide, ou à un changement de molécule argumenté en cas de non réponse au traitement. Bien que d'autres études soient nécessaires pour préciser quels marqueurs seraient les plus pertinents, quel serait le meilleur moment pour leur détermination et affiner la fourchette thérapeutique, cette approche apparaît prometteuse. Mais actuellement, le niveau de preuve du suivi thérapeutique pharmacologique du méthotrexate à faible dose dans les pathologies inflammatoires ne peut être classé que « restant à évaluer ».