Le diagnostic génomique viral est réalisé systématiquement sur les dons de sang en France depuis le 01/07/2001. C’est l’histoire d’une décision controversée. « L’inacceptable risque VIH », dans le contexte du début des années 2000, a pesé sur cette décision. Le bilan de ces presque dix ans est réalisé au vu des avancées escomptées de ce nouvel outil de dépistage des agents infectieux en transfusion et confirme la pertinence des modèles des experts. Sur les 22,3 millions de dons de la période (2001–2009), 22 dons ont été écartés du seul fait du diagnostic génomique viral, pour le virus de l’hépatite C (n = 11) et pour le virus de l’immunodéficience humaine (n = 11). Le diagnostic génomique viral a contribué à l’amélioration du fonctionnement des activités de la chaîne transfusionnelle afin de garantir la disponibilité des produits sanguins. En matière de réactivité vis-à-vis d’agents infectieux émergents, l’action menée vis-à-vis du virus du Nil Occidental est exemplaire, mais le diagnostic génomique viral n’a pas été une aide dans les autres crises du même ordre. L’arrêt du dosage des transaminases est à porter au crédit du diagnostic génomique viral. Le risque de contamination de la méthode par les produits d’amplification s’est vérifié et la prudence en la matière reste de mise. Le diagnostic génomique viral est maintenu et a franchi en 2010 une nouvelle étape avec l’introduction d’un automate, en abandonnant le dépistage en pool et en généralisant le dépistage du virus de l’hépatite B. La poursuite du diagnostic génomique viral pourrait être révisée lorsque les méthodes d’inactivation des pathogènes seront en place pour tous les produits sanguins.