Au Togo, à l'instar des autres pays en développement, les données sur la qualité des prestations des laboratoires d'analyses médicales sont quasi inexistantes, le pays ne disposant pas d'un organe de contrôle de qualité. L'étude que nous avons entreprise de mai à août 2006 a eu pour objectif d'évaluer le niveau de qualité de cinq laboratoires de bactériologie médicale du Togo. Cette étude fut un audit à questionnaires ouverts portant sur la fiabilité des résultats et sur l'organisation technique des laboratoires. Comme référentiels d'étude, nous avons utilisé la norme ISO 15189:2003, le Guide de bonne exécution des analyses de biologie médicale du Togo (GBEA-Togo) et le document de standardisation de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) en bactériologie médicale. Les résultats de l'audit sur la fiabilité des résultats ont montré le manque de certains milieux de culture dans les laboratoires, un choix inadapté de ces milieux de culture pour le traitement des échantillons, une identification incomplète de certaines bactéries, un manque de réactifs de diagnostics et une incapacité de ces laboratoires à identifier certains micro-organismes potentiellement pathogènes. Concernant l'audit sur l'organisation technique des laboratoires, une conformité moyenne variant de 25,8 à 54,8 % a été obtenue. Ce qui indique une insuffisance dans l'organisation technique de ces laboratoires. Au terme de cette étude, il ressort que les laboratoires doivent s'équiper en matériel et en réactifs, améliorer leur organisation technique et instaurer un programme d'autoévaluation et de maintenance des équipements.