But de l’étudeLa technique Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time Of Flight (MALDI-TOF) est en plein essor. Elle permet d’obtenir un spectre des protéines ribosomales et de membranes en fonction de leur poids, ce spectre comparé à une base de données permet d’identifier les microorganismes. Le laboratoire de microbiologie du centre hospitalier de Mulhouse a fait l’acquisition de cette technique en mai 2009.MéthodeNous avons utilisé le spectromètre de masse Axima®(Shimatzu) couplé au logiciel Saramis®(Anagnostec), l’intégration à l’informatique du laboratoire se faisant via le logiciel SirWeb®(société I2A). La majorité des souches isolées dans le laboratoire a été analysée en spectrométrie.RésultatsLa technique a rapidement été acquise par l’ensemble du personnel du laboratoire. Pendant cette étude, 98,8 % des isolats analysés ont été identifiés jusqu’à l’espèce, voire la sous espèce. Le recours à une autre technique, essentiellement la biologie moléculaire a rarement été nécessaire, ce recours étant limité aux isolats cliniquement significatifs. L’utilisation de la spectrométrie de masse permet une identification rapide et précise de la majorité des microorganismes rencontrés dans notre activité. La base Saramis comprend des espèces rares et d’identification fastidieuse par les techniques classiques, certaines lacunes sont à combler. Les superspectres, spécifiques de la base Saramis®permettent une validation technique très fiable.ConclusionLa spectrométrie de masse s’est donc parfaitement intégrée à notre activité de routine, l’identification et l’antibiogramme se faisant plus souvent à partir d’une seule colonie. La coloration de Gram et les tests simples gardent tout leur intérêt.