La chirurgie de l'épilepsie est possible dans certains cas d'épilepsie pharmaco-résistante à point de départ focal et peut souvent mener à un contrôle complet des crises. Un bilan préchirurgical est nécessaire pour localiser le foyer épileptique et préciser les risques de séquelles neurologiques et cognitives. Même lorsque l'IRM cérébrale ne montre pas de lésion, d'autres techniques d'imagerie et éventuellement l'implantation d'électrodes intracrâniennes peuvent permettre une chirurgie couronnée de succès. Tous les patients souffrant d'épilepsie pharmaco-résistante devraient bénéficier d'une évaluation dans un centre spécialisé en vue de confirmer le diagnostic et d'évaluer la possibilité d'un traitement chirurgical. Chez les enfants, la chirurgie de l'épilepsie relativement précoce permet souvent d'améliorer le développement cognitif et la scolarité.