La néphropathie chronique d'allogreffe constitue la cause principale de perte des greffons rénaux à long terme. Elle peut être détectée précocement par des biopsies de dépistage effectuées de manière systématique. La classification usuelle, semi-quantitative, souffre d'une mauvaise reproductibilité. Diverses méthodes morphométriques ont donc été développées pour quantifier la fibrose interstitielle qui caractérise cette néphropathie. Certaines utilisent la coloration spécifique par le rouge Sirius. L'analyse d'image couleur par segmentation permet une quantification automatique, rapide et robuste de la fibrose interstitielle. Elle utilise une segmentation couleur associée à une analyse de couleur, de localisation spatiale et de forme sur des biopsies colorées au trichrome de Masson. À l'avenir, l'étude des collagènes fibrillaires par la génération de second harmonique pourrait permettre une approche spécifique des composants de la fibrose.