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Mise au point d’une technique de PCR en temps réel pour la détection rapide des gènes qnr chez des entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu

Auteurs : Guillard T, Cavallo J-D1, Cambau E2, Duval V3, Bajolet O3, Brasme L3, de Champs C3, Vernet-Garnier V3
Affiliations : 1École du Val-de-Grâce, Paris, France2Laboratoire de bactériologie-virologie-hygiène, hôpital Henri-Mondor, AP–HP, 50, avenue du Maréchal-de-Lattre-de-Tassigny, 94000 Créteil, France3Laboratoire de bactériologie-virologie-hygiène, CHU Robert-Debré, rue du Général-Koenig, 51092 Reims cedex, France
Date 2010 Décembre, Vol 58, Num 6, pp 430-433Revue : Pathologie-biologieType de publication : article de périodique; DOI : 10.1016/j.patbio.2009.03.003
Article original
Résumé

But de l’étudeLe but de cette étude était de développer une méthode de PCR en temps réel permettant de détecter rapidement les gènes de résistance plasmidique aux quinolonesqnr.MéthodesLa technique de PCR en temps réel avec SYBR Green I a été développée sur l’automate Roche LightCycler®. La détection des gènesqnrétait réalisée par comparaison des courbes de fusion à celle d’un témoin positif. Cette étude a permis d’étudier 138 souches isolées de prélèvements diagnostiques ou écologiques en Champagne-Ardenne en 2004.RésultatsAprès optimisation de la technique, la spécificité des amorces a été confirmée en testant les trois contrôles positifs seuls, puis en présence des souches à tester. Chaque PCR permettait de rechercher sur 30 souches un gèneqnren 60 minutes. Parmi 138 souches, 3,6 % des souches étaient porteuses deqnrA1, 1,5 % deqnrS1 et aucune ne présentait le gèneqnrB. La prévalence du déterminant de résistanceqnrétait de 5 % et atteignait 9,5 % pour les seules souches isolées de prélèvements diagnostiques.ConclusionCette technique de PCR est une méthode de détection rapide des gènesqnr. Cette étude rapporte une relativement forte prévalence (5 %) deqnrparmi les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (EBLSE) isolées en Champagne-Ardenne en 2004.

Mot-clés auteurs
PCR temps réel; SYBR Green; ; ;
 Source : Elsevier-Masson
 Source : MEDLINE©/Pubmed© U.S National Library of Medicine
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Guillard T, Cavallo J-D, Cambau E, Duval V, Bajolet O, Brasme L, de Champs C, Vernet-Garnier V. Mise au point d’une technique de PCR en temps réel pour la détection rapide des gènes qnr chez des entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu. Pathologie-biologie. 2010 Déc;58(6):430-433.
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Dernière date de mise à jour : 27/11/2015.


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