Les entérovirus non poliovirus sont des agents infectieux qui peuvent déterminer des infections variées. Ils sont de plus en plus isolés dans le cadre de la surveillance des paralysies flasques aiguës (PFA) et posent un problème d'identification antigénique. En Côte d'Ivoire, les sérotypes des entérovirus non Poliovirus (EVNP) circulants sont mal connus. Afin de déterminer les caractéristiques épidémiologiques et virologiques des EVNP issus des investigations virologiques de 1996 à 2004, des souches d'entérovirus isolés à partir de selles et de liquide céphalo-rachidien ont été analysées. Les produits biologiques ont été traités suivant les procédures préconisées par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) dans le cadre la surveillance virologique des PFA, et l'identification antigénique a été réalisée par séroneutralisation. Sur 1 444 isolats obtenus à partir de 10187 échantillons, 637 étaient des Poliovirus et 807 des souches d'EVNP soit 7,9 %. Parmi elles, 16,3 % ont été isolées au cours des études de portage et 83,7 % associées à des cas de PFA. Des 807 souches d'EVNP, 218 souches ont fait l'objet de sérotypage et le sérotype de 77 souches (35,3 %) a pu être déterminé : Coxsackievirus B (41,6 %) et Echovirus de différents sérotypes (58,4 %). La proportion de souches non-typables (62,3 %) confirme les difficultés d'identification des ENPV avec les réactifs disponibles. Le diagnostic moléculaire devient nécessaire afin de répertorier les sérotypes d'EVNP circulant et associés à des manifestations cliniques dans le pays.