Après les applications réfractives, se développent actuellement les applications thérapeutiques du laser femtoseconde, dont les kératoplasties lamellaires et transfixiantes. L'utilisation de cet outil dans ces domaines semble logique, puisqu'il permet de réaliser des dissections dans toutes les directions de l'espace avec une précision de l'ordre de quelques microns. Il facilite les découpes lamellaires, et garantit une qualité anatomique satisfaisante sauf en cas de dissection profonde, les dissections prédescemétiques demeurant impossibles. L'amélioration des résultats fonctionnels reste à démontrer. Il permet également la réalisation de profils de découpes transfixiantes à bords non verticaux dans le but de diminuer la fréquence et/ou l'importance des complications habituelles (astigmatisme, récupération fonctionnelle lente, déhiscence de la cicatrice). Cette application est débutante, mais prometteuse. Cependant, seule l'expérience permettra de définir plus précisément la place du laser femtoseconde dans ce champ d'application.