Les séquences de spectroscopie par résonance magnétique (SRM) permettent une exploration non invasive du métabolisme cérébral au cours d'un examen IRM. Les améliorations récentes, en termes de programmation des séquences et de quantification des métabolites, les rendent maintenant facilement utilisables dans un cadre clinique. Pour obtenir un examen informatifet de qualité, certaines règles simples doivent être respectées dans le choix des séquences et le positionnement des voxels. Il faut distinguer les applications de recherche de la SRM, où cet examen a principalement pour but de mieux comprendre la physiopathologie d'une maladie et ses indications cliniques, où cette exploration peut fournir des éléments directement utiles à la prise en charge du malade. Ces dernières sont principalement les tumeurs cérébrales (diagnostic étiologique et différentiel, bilan d'extension et suivi thérapeutique), la souffrance cérébrale diffuse, les encéphalopathies (hépatique et liée au VIH en particulier) et le diagnostic des maladies métaboliques.