Les anomalies chromosomiques observées dans les tumeurs gliales humaines sont surtout numériques, entrainant des pertes et des gains de certains chromosomes. Dans les formes les moins évoluées, le caryotype est normal ou montre une perte de chromosome sexuel et un gain de chromosome 7, anomalies qui ne témoignent pas nécessirement d'un état malin. Le gain de chromosome 7 et la perte du 10 sont les deux anomalies les plus fréquentes dans les formes plus évoluées, où s'ajoutent, un peu moins souvent, des pertes ou delétions du 9, du 22, du 6, du 13 et du 14.