L'accès à l'IRM étant restreint, le scanner maintient un rôle important dans le diagnostic des maladies des voies biliaires intra et extra-hépatiques. Aux vues des innovations techniques dues à l'introduction du scanner multidétecteur, il convient de revoir le rôle respectif des deux méthodes d'imagerie et de définir notamment les situations dans lesquelles l'IRM est indispensable et dans lesquelles le scanner peut suffire. La cholangiographie par IRM est la technique d'imagerie non invasive la plus fiable pour la détection de la cholédocholithiase et la littérature actuelle ne fournit pas de preuve que le scanner puisse remplacer l'IRM pour cette indication. Dans le contexte des sténoses et des malformations kystiques, l'information fournie par le scanner avec produit de contraste et surtout avec les reconstructions 2D et 3D est souvent suffisante du point de vue clinique.