Les principales infections virales pouvant faire l'objet d'un diagnostic anténatal sont: les infections à cytomégalovirus (CMV) et à parvovirus B19, la rubéole et la varicelle. Le diagnostic anténatal repose sur la mise en évidence directe du virus par culture (CMV), de ses antigènes (CMV) ou encore de son génome, essentiellement par PCR. Cette recherche directe peut être réalisée soit sur le sang fœtal, soit sur le liquide amniotique. Le diagnostic anténatal peut également être réalisé par recherche d'IgM spécifiques dans le sang foetal (rubéole). Les marqueurs non spécifiques d'infections virales peuvent aider au diagnostic. À l'heure actuelle, le diagnostic des infections foetales repose essentiellement sur la mise en évidence du génome viral dans le liquide amniotique. Afin de mieux apprécier la gravité des infections foetales, plusieurs équipes ont tenté de mettre en évidence des facteurs pronostiques de ces infections. La charge virale pourrait jouer un rôle dans certaines infections.