Nous rapportons deux cas de kératite à mycobactéries atypiques survenues respectivement au décours d'un traumatisme oculaire accidentel avec impaction d'un corps étranger cornéen et dans les suites d'une kératoplastie transfixiante pour brûlure par base. L'aspect clinique initial était celui d'un infiltrat blanchâtre d'évolution indolente et résistant au traitement antibiotique local. Une kératopathie cristalline infectieuse d'intensité différente était constatée secondairement. Dans le premier cas, la mise en évidence de Mycobacterium abscessus était réalisée à partir de la pièce de kératectomie lamellaire tandis que Mycobacterium chelonae était isolée d'une biopsie cornéenne dans le second cas. L'infection opportuniste résistait à l'application topique de ciprofloxacine et d'amikacine associée à la prise orale d'un macrolide de nouvelle génération. Le premier patient présentait une récidive après kératectomie lamellaire. L'arrêt des corticostéroïdes locaux entraînait une évolution inflammatoire et nécrotique chez le second patient. Dans les deux cas, seule une kératoplastie transfixiante permettait d'obtenir la guérison de l'infection. Ces observations incitent à proposer une recherche systématique de mycobactéries atypiques en cas d'abcès cornéen indolent ou de kératopathie cristalline infectieuse.