Tous les événements hormonaux de la vie de la femme peuvent modifier le cours de la maladie migraineuse. Leur influence est un peu différente selon qu'il s'agit de migraines sans aura ou de migraines avec aura. Le déclenchement de la maladie lors de la puberté, puis la survenue des crises au moment des règles s'observent principalement pour les migraines sans aura. L'estradiol par voie percutanée est un traitement souvent efficace des migraines menstruelles pures. La grossesse apporte une amélioration dans la majorité des cas; une aggravation ou une apparition des premières crises migraineuses peut néanmoins être notée durant cette période, en particulier pour la migraine avec aura. Les migraineuses sont, dans leur majorité, autorisées à utiliser la pilule, qui peut aggraver, améliorer ou laisser inchangée leur maladie. La migraine représente chez les femmes jeunes un risque d'accident ischémique cérébral, faible en chiffre absolu, mais qui invite à certaines précautions: proscrire le tabac en cas d'association à la pilule, utiliser des contraceptifs faiblement dosés en oestrogènes, interrompre les oestroprogestatifs en cas d'aggravation importante des migraines, surtout si elles comportent une aura. La migraine n'est jamais une contre-indication au traitement hormonal substitutif de la ménopause; il arrive que celui-ci aggrave les crises, ce qui peut le plus souvent être contrôlé par un ajustement thérapeutique.