Les méthodes classiquement utilisées pour analyser l'expression génique dans les tissus ne permettent généralement d'analyser qu'un seul gène ou une seule protéine à la fois. Une nouvelle technique d'analyse d'expression dite « DNA array » ou membrane à « haute densité » permet d'analyser simultanément plusieurs centaines de gènes. Il s'agit d'un support de nylon sur lequel sont fixés sous forme de micro-spots une multitude d'échantillons d'ADN complémentaires (ADNc) spécifiques de différents gènes. Ce filtre est hybridé avec une sonde dite « complexe » dérivée d'ARN messager (ARNm) extrait des cellules ou tissus à tester. Les signaux d'hybridation donnent alors le profil instantané global de l'expression génique dans le tissu dont la sonde est dérivée. Cette technique présente l'avantage de permettre de quantifier l'expression des ARNm et de pouvoir comparer les profils d'expression dans différents types cellulaires ou tissus.